近年来医学技术系获得众多荣誉，医学检验教研室团队2016年5月被授予“赣州市工人先锋号”，2018年12月被授予“赣州市青年文明号”，医学检验技术专业学生在2014-2017连续四年获得全国检验技能竞赛团体二等奖，2018年获全国检验技能竞赛团体一等奖。2021年获第五届全国医学检验技术专业大学生在线形态大赛获特等奖和一等奖、第四届全国医学检验金微课大赛特等奖；2022年获第六届全国医学检验技术专业大学生在线形态大赛获一等奖和二等奖、第一届全国虚拟仿真临床实验诊断大赛特等奖和一等奖、第五届全国医学检验金微课大赛特等奖，在2022年获第八届江西省“互联网＋”大学生创新创业大赛获银奖和铜奖，2022年获的十三届“挑战杯”江西省创新创业计划竞赛银奖。卫生检验与检疫技术学生在2022年江西省职业技能大赛农产品质量安全检测项目中获团体三等奖。五年一贯制医学检验技术学生在2022年获第十六届江西省运动会田径比赛荣获男子专科甲10000米，男子专科甲组5000米竞走双料冠军并破该项目省记录。