临床医学系成立于2019年1月，下设行政与教学工作办公室、团学工作办公室、内科学与儿科学教研室、外科学与妇产科学教研室、诊断学与预防医学教研室。现开设有大专层次三年制临床医学、预防医学两个国家控制的医药卫生类专业，以及1个面向基层医疗卫生定向培养的中专层次四年制农村医学专业，现有班级17个，学生数共计991人。

系部拥有一支结构合理、素质优良、敢闯敢拼的师资队伍。现有教职工36人，教辅人员3人，专职教师25人，其中正高职称2人，副高职称8人，中级职称15人，硕士研究生6人。拥有院级专业建设团队1个、学科创新教学建设团队3个，市级“三八红旗集体”1个，市级“五一劳动奖章”获得者1人，市级优秀教师2人。

临床医学系坚持以国控专业建设为龙头，以基层卫生服务专业群建设为抓手，以内涵发展为重点，积极推进“三教”改革，建立健全校院合作、医教协同育人机制，充分挖掘附属医院、教学医院资源，推进校院合作临床教学，开发“临床床边教材”，构建“工学结合”、“现代学徒制”教学模式，探索实施“1+1+1”人才培养新模式，大力促进临床医学专业教学共同体的形成，着力培养高素质技术技能实践型人才，为区域医药卫生事业发展提供坚实的人才支撑。